Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdf1P59326 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdf1P59326 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdf1P59326 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdf1P59326 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdf1P59326 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdf1P59326 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdf1P59326 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdf1P59326 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdf1P59326 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdf1P59326 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdf1P59326 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdf1P59326 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdf1P59326 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdf1P59326 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdf1P59326 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdf1P59326 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdf1P59326 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdf1P59326 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdf1P59326 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdf1P59326 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdf1P59326 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdf1P59326 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdf1P59326 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdf1P59326 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdf1P59326 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdf1P59326 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdf1P59326 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms