Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lim2P56563 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lim2P56563 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lim2P56563 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lim2P56563 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lim2P56563 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lim2P56563 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lim2P56563 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lim2P56563 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lim2P56563 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lim2P56563 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lim2P56563 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lim2P56563 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lim2P56563 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lim2P56563 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lim2P56563 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lim2P56563 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lim2P56563 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lim2P56563 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lim2P56563 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lim2P56563 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lim2P56563 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lim2P56563 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lim2P56563 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lim2P56563 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lim2P56563 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lim2P56563 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lim2P56563 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lim2P56563 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lim2P56563 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lim2P56563 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Lim2P56563 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lim2P56563 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lim2P56563 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lim2P56563 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lim2P56563 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lim2P56563 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lim2P56563 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lim2P56563 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lim2P56563 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lim2P56563 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lim2P56563 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lim2P56563 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lim2P56563 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lim2P56563 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lim2P56563 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms