Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CckbrP56481 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CckbrP56481 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CckbrP56481 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CckbrP56481 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CckbrP56481 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CckbrP56481 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CckbrP56481 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CckbrP56481 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CckbrP56481 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CckbrP56481 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CckbrP56481 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CckbrP56481 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CckbrP56481 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CckbrP56481 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CckbrP56481 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CckbrP56481 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CckbrP56481 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CckbrP56481 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CckbrP56481 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CckbrP56481 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CckbrP56481 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CckbrP56481 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CckbrP56481 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CckbrP56481 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CckbrP56481 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CckbrP56481 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CckbrP56481 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CckbrP56481 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CckbrP56481 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CckbrP56481 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CckbrP56481 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CckbrP56481 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CckbrP56481 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CckbrP56481 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CckbrP56481 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CckbrP56481 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CckbrP56481 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CckbrP56481 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CckbrP56481 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CckbrP56481 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CckbrP56481 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CckbrP56481 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CckbrP56481 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CckbrP56481 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CckbrP56481 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CckbrP56481 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CckbrP56481 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CckbrP56481 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CckbrP56481 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CckbrP56481 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms