Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtskP55097 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtskP55097 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtskP55097 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtskP55097 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtskP55097 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtskP55097 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtskP55097 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtskP55097 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtskP55097 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtskP55097 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtskP55097 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtskP55097 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtskP55097 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CtskP55097 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtskP55097 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtskP55097 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtskP55097 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CtskP55097 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtskP55097 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtskP55097 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtskP55097 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtskP55097 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtskP55097 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtskP55097 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtskP55097 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtskP55097 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtskP55097 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtskP55097 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtskP55097 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtskP55097 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtskP55097 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtskP55097 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtskP55097 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtskP55097 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtskP55097 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtskP55097 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtskP55097 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtskP55097 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtskP55097 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtskP55097 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtskP55097 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtskP55097 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CtskP55097 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtskP55097 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtskP55097 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtskP55097 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CtskP55097 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtskP55097 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtskP55097 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtskP55097 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtskP55097 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtskP55097 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CtskP55097 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtskP55097 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtskP55097 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CtskP55097 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtskP55097 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtskP55097 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtskP55097 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtskP55097 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtskP55097 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtskP55097 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtskP55097 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtskP55097 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtskP55097 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtskP55097 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtskP55097 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtskP55097 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtskP55097 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CtskP55097 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtskP55097 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CtskP55097 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtskP55097 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtskP55097 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtskP55097 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtskP55097 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtskP55097 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtskP55097 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtskP55097 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtskP55097 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtskP55097 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtskP55097 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtskP55097 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtskP55097 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtskP55097 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtskP55097 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtskP55097 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CtskP55097 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtskP55097 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtskP55097 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms