Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Cux1P53564 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Cux1P53564 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Cux1P53564 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Cux1P53564 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Cux1P53564 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Cux1P53564 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Cux1P53564 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Cux1P53564 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Cux1P53564 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Cux1P53564 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Cux1P53564 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Cux1P53564 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Cux1P53564 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Cux1P53564 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Cux1P53564 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Cux1P53564 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Cux1P53564 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Cux1P53564 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Cux1P53564 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Cux1P53564 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cux1P53564 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cux1P53564 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Cux1P53564 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Cux1P53564 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Cux1P53564 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Cux1P53564 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Cux1P53564 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Cux1P53564 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Cux1P53564 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Cux1P53564 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Cux1P53564 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
Cux1P53564 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Cux1P53564 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Cux1P53564 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Cux1P53564 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Cux1P53564 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Cux1P53564 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Cux1P53564 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Cux1P53564 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Cux1P53564 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
Cux1P53564 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Cux1P53564 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Cux1P53564 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Cux1P53564 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Cux1P53564 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Cux1P53564 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cux1P53564 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cux1P53564 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Cux1P53564 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
Cux1P53564 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Cux1P53564 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Cux1P53564 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Cux1P53564 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cux1P53564 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cux1P53564 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cux1P53564 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Cux1P53564 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Cux1P53564 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cux1P53564 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cux1P53564 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Cux1P53564 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Cux1P53564 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Cux1P53564 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cux1P53564 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cux1P53564 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cux1P53564 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cux1P53564 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cux1P53564 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Cux1P53564 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Cux1P53564 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Cux1P53564 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Cux1P53564 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Cux1P53564 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Cux1P53564 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Cux1P53564 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Cux1P53564 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Cux1P53564 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Cux1P53564 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Cux1P53564 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Cux1P53564 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Cux1P53564 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cux1P53564 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cux1P53564 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cux1P53564 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Cux1P53564 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Cux1P53564 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms