Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
ClgnP52194 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
ClgnP52194 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
ClgnP52194 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
ClgnP52194 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
ClgnP52194 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
ClgnP52194 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
ClgnP52194 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
ClgnP52194 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
ClgnP52194 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
ClgnP52194 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
ClgnP52194 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
ClgnP52194 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
ClgnP52194 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
ClgnP52194 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
ClgnP52194 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
ClgnP52194 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
ClgnP52194 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
ClgnP52194 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
ClgnP52194 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,19■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
ClgnP52194 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
ClgnP52194 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,11■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,08■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
ClgnP52194 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
ClgnP52194 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
ClgnP52194 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
ClgnP52194 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
ClgnP52194 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
ClgnP52194 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,04■■□□□ 1,6
ClgnP52194 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
ClgnP52194 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
ClgnP52194 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1,59
ClgnP52194 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
ClgnP52194 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
ClgnP52194 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1,59
ClgnP52194 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25■■□□□ 1,59
ClgnP52194 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,99■■□□□ 1,59
ClgnP52194 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
ClgnP52194 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
ClgnP52194 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,92■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,9■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
ClgnP52194 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
ClgnP52194 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
ClgnP52194 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,7 ms