Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa13P50711 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa13P50711 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa13P50711 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa13P50711 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa13P50711 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa13P50711 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa13P50711 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa13P50711 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa13P50711 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa13P50711 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa13P50711 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa13P50711 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa13P50711 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa13P50711 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa13P50711 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa13P50711 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa13P50711 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa13P50711 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa13P50711 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa13P50711 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa13P50711 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa13P50711 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa13P50711 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa13P50711 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa13P50711 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa13P50711 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa13P50711 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa13P50711 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa13P50711 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms