Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cox8bP48772 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cox8bP48772 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox8bP48772 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox8bP48772 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cox8bP48772 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms