Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfsf4P43488 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfsf4P43488 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfsf4P43488 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnfsf4P43488 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnfsf4P43488 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfsf4P43488 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf4P43488 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf4P43488 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfsf4P43488 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf4P43488 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf4P43488 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf4P43488 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms