Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fen1P39749 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fen1P39749 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fen1P39749 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fen1P39749 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fen1P39749 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fen1P39749 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fen1P39749 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fen1P39749 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fen1P39749 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fen1P39749 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fen1P39749 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fen1P39749 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fen1P39749 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fen1P39749 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fen1P39749 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fen1P39749 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fen1P39749 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fen1P39749 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fen1P39749 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fen1P39749 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fen1P39749 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fen1P39749 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fen1P39749 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fen1P39749 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fen1P39749 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fen1P39749 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fen1P39749 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fen1P39749 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fen1P39749 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fen1P39749 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fen1P39749 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fen1P39749 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fen1P39749 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fen1P39749 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fen1P39749 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fen1P39749 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fen1P39749 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fen1P39749 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fen1P39749 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fen1P39749 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fen1P39749 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms