Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TtlP38585 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TtlP38585 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TtlP38585 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TtlP38585 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TtlP38585 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TtlP38585 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TtlP38585 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TtlP38585 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TtlP38585 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TtlP38585 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TtlP38585 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TtlP38585 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TtlP38585 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TtlP38585 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TtlP38585 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TtlP38585 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TtlP38585 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TtlP38585 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TtlP38585 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TtlP38585 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TtlP38585 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TtlP38585 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TtlP38585 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TtlP38585 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TtlP38585 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TtlP38585 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TtlP38585 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TtlP38585 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TtlP38585 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TtlP38585 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TtlP38585 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TtlP38585 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TtlP38585 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TtlP38585 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TtlP38585 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TtlP38585 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TtlP38585 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TtlP38585 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TtlP38585 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TtlP38585 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TtlP38585 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TtlP38585 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TtlP38585 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TtlP38585 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TtlP38585 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TtlP38585 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TtlP38585 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TtlP38585 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TtlP38585 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TtlP38585 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TtlP38585 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TtlP38585 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TtlP38585 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TtlP38585 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TtlP38585 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TtlP38585 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TtlP38585 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TtlP38585 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TtlP38585 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TtlP38585 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TtlP38585 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TtlP38585 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TtlP38585 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TtlP38585 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TtlP38585 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TtlP38585 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TtlP38585 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TtlP38585 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TtlP38585 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TtlP38585 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TtlP38585 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TtlP38585 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TtlP38585 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TtlP38585 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TtlP38585 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TtlP38585 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TtlP38585 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TtlP38585 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TtlP38585 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TtlP38585 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TtlP38585 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TtlP38585 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TtlP38585 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TtlP38585 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TtlP38585 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TtlP38585 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TtlP38585 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TtlP38585 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TtlP38585 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TtlP38585 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TtlP38585 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TtlP38585 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TtlP38585 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TtlP38585 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TtlP38585 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TtlP38585 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TtlP38585 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TtlP38585 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TtlP38585 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms