Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab17P35292 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab17P35292 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab17P35292 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab17P35292 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab17P35292 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab17P35292 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab17P35292 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab17P35292 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab17P35292 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab17P35292 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab17P35292 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab17P35292 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab17P35292 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab17P35292 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab17P35292 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab17P35292 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab17P35292 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab17P35292 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab17P35292 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab17P35292 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab17P35292 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab17P35292 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab17P35292 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab17P35292 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab17P35292 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab17P35292 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab17P35292 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab17P35292 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab17P35292 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab17P35292 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab17P35292 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab17P35292 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab17P35292 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab17P35292 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab17P35292 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab17P35292 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab17P35292 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab17P35292 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab17P35292 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab17P35292 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab17P35292 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab17P35292 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab17P35292 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab17P35292 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab17P35292 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rab17P35292 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rab17P35292 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab17P35292 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab17P35292 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms