Protein–RNA interactions for Protein: P31996

Cd68, Macrosialin, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd68P31996 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd68P31996 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd68P31996 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd68P31996 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cd68P31996 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cd68P31996 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd68P31996 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd68P31996 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd68P31996 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd68P31996 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd68P31996 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd68P31996 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd68P31996 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd68P31996 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd68P31996 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cd68P31996 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cd68P31996 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cd68P31996 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cd68P31996 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cd68P31996 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd68P31996 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd68P31996 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd68P31996 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cd68P31996 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd68P31996 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd68P31996 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd68P31996 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd68P31996 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd68P31996 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cd68P31996 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd68P31996 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cd68P31996 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cd68P31996 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cd68P31996 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cd68P31996 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cd68P31996 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd68P31996 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd68P31996 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd68P31996 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd68P31996 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd68P31996 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cd68P31996 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cd68P31996 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cd68P31996 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd68P31996 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cd68P31996 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cd68P31996 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd68P31996 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd68P31996 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd68P31996 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd68P31996 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd68P31996 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd68P31996 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd68P31996 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cd68P31996 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cd68P31996 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd68P31996 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cd68P31996 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd68P31996 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms