Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Notch4P31695 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Notch4P31695 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Notch4P31695 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Notch4P31695 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Notch4P31695 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Notch4P31695 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Notch4P31695 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Notch4P31695 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Notch4P31695 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Notch4P31695 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Notch4P31695 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Notch4P31695 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Notch4P31695 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Notch4P31695 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Notch4P31695 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Notch4P31695 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Notch4P31695 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Notch4P31695 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Notch4P31695 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Notch4P31695 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Notch4P31695 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Notch4P31695 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Notch4P31695 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Notch4P31695 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Notch4P31695 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Notch4P31695 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Notch4P31695 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Notch4P31695 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Notch4P31695 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Notch4P31695 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Notch4P31695 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Notch4P31695 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Notch4P31695 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Notch4P31695 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Notch4P31695 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Notch4P31695 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Notch4P31695 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Notch4P31695 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Notch4P31695 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Notch4P31695 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Notch4P31695 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Notch4P31695 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Notch4P31695 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Notch4P31695 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Notch4P31695 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Notch4P31695 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Notch4P31695 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Notch4P31695 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Notch4P31695 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms