Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa4P28311 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa4P28311 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa4P28311 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa4P28311 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa4P28311 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Defa4P28311 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,93■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa4P28311 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,9■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Defa4P28311 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,85■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Defa4P28311 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,84■□□□□ 0,29
Defa4P28311 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,82■□□□□ 0,28
Defa4P28311 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defa4P28311 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Defa4P28311 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16,77■□□□□ 0,28
Defa4P28311 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16,76■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16,74■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Defa4P28311 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Defa4P28311 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Defa4P28311 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16,7■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,7■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16,69■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,68■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Defa4P28311 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa4P28311 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms