Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CenpbP27790 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CenpbP27790 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CenpbP27790 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CenpbP27790 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CenpbP27790 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CenpbP27790 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CenpbP27790 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CenpbP27790 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CenpbP27790 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CenpbP27790 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CenpbP27790 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CenpbP27790 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CenpbP27790 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CenpbP27790 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CenpbP27790 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CenpbP27790 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CenpbP27790 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CenpbP27790 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CenpbP27790 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CenpbP27790 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CenpbP27790 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CenpbP27790 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CenpbP27790 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CenpbP27790 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CenpbP27790 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CenpbP27790 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CenpbP27790 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CenpbP27790 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CenpbP27790 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CenpbP27790 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CenpbP27790 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CenpbP27790 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CenpbP27790 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CenpbP27790 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CenpbP27790 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CenpbP27790 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CenpbP27790 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CenpbP27790 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CenpbP27790 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CenpbP27790 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CenpbP27790 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CenpbP27790 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CenpbP27790 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CenpbP27790 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CenpbP27790 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CenpbP27790 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CenpbP27790 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CenpbP27790 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CenpbP27790 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CenpbP27790 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CenpbP27790 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CenpbP27790 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CenpbP27790 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CenpbP27790 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CenpbP27790 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CenpbP27790 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CenpbP27790 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CenpbP27790 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CenpbP27790 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CenpbP27790 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CenpbP27790 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CenpbP27790 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CenpbP27790 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CenpbP27790 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CenpbP27790 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.4 ms