Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabrg3P27681 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabrg3P27681 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabrg3P27681 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabrg3P27681 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabrg3P27681 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabrg3P27681 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabrg3P27681 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabrg3P27681 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabrg3P27681 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabrg3P27681 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabrg3P27681 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabrg3P27681 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabrg3P27681 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabrg3P27681 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabrg3P27681 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabrg3P27681 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrg3P27681 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrg3P27681 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrg3P27681 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrg3P27681 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabrg3P27681 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrg3P27681 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrg3P27681 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrg3P27681 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrg3P27681 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabrg3P27681 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabrg3P27681 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabrg3P27681 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gabrg3P27681 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gabrg3P27681 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabrg3P27681 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrg3P27681 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabrg3P27681 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabrg3P27681 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabrg3P27681 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabrg3P27681 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabrg3P27681 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrg3P27681 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gabrg3P27681 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrg3P27681 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabrg3P27681 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gabrg3P27681 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabrg3P27681 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabrg3P27681 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabrg3P27681 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabrg3P27681 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms