Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpm3P21107 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpm3P21107 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tpm3P21107 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpm3P21107 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpm3P21107 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tpm3P21107 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm3P21107 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm3P21107 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm3P21107 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpm3P21107 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tpm3P21107 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm3P21107 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpm3P21107 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tpm3P21107 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tpm3P21107 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpm3P21107 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpm3P21107 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpm3P21107 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpm3P21107 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpm3P21107 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpm3P21107 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpm3P21107 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tpm3P21107 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm3P21107 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Tpm3P21107 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpm3P21107 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpm3P21107 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tpm3P21107 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpm3P21107 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpm3P21107 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpm3P21107 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tpm3P21107 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tpm3P21107 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpm3P21107 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpm3P21107 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpm3P21107 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm3P21107 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm3P21107 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tpm3P21107 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms