Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ifrd1P19182 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifrd1P19182 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ifrd1P19182 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ifrd1P19182 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifrd1P19182 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifrd1P19182 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifrd1P19182 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifrd1P19182 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifrd1P19182 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifrd1P19182 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifrd1P19182 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifrd1P19182 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ifrd1P19182 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ifrd1P19182 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifrd1P19182 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifrd1P19182 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifrd1P19182 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifrd1P19182 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifrd1P19182 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifrd1P19182 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ifrd1P19182 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ifrd1P19182 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ifrd1P19182 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ifrd1P19182 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifrd1P19182 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ifrd1P19182 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifrd1P19182 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifrd1P19182 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifrd1P19182 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifrd1P19182 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifrd1P19182 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ifrd1P19182 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifrd1P19182 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifrd1P19182 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifrd1P19182 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifrd1P19182 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifrd1P19182 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifrd1P19182 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifrd1P19182 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifrd1P19182 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifrd1P19182 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifrd1P19182 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifrd1P19182 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifrd1P19182 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifrd1P19182 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms