Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnc1P19123 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnc1P19123 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnnc1P19123 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnnc1P19123 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnnc1P19123 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnc1P19123 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnc1P19123 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnnc1P19123 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnc1P19123 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnnc1P19123 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnc1P19123 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnnc1P19123 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnnc1P19123 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnnc1P19123 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnnc1P19123 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnnc1P19123 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnc1P19123 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnc1P19123 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnc1P19123 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnnc1P19123 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnnc1P19123 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnnc1P19123 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnnc1P19123 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms