Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtpraP18052 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtpraP18052 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtpraP18052 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtpraP18052 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtpraP18052 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PtpraP18052 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtpraP18052 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtpraP18052 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtpraP18052 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtpraP18052 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtpraP18052 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtpraP18052 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtpraP18052 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtpraP18052 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtpraP18052 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtpraP18052 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtpraP18052 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtpraP18052 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtpraP18052 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtpraP18052 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtpraP18052 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpraP18052 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtpraP18052 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtpraP18052 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtpraP18052 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PtpraP18052 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtpraP18052 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtpraP18052 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PtpraP18052 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtpraP18052 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtpraP18052 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtpraP18052 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtpraP18052 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtpraP18052 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PtpraP18052 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtpraP18052 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtpraP18052 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtpraP18052 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtpraP18052 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PtpraP18052 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtpraP18052 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtpraP18052 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtpraP18052 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtpraP18052 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtpraP18052 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtpraP18052 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PtpraP18052 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpraP18052 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpraP18052 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtpraP18052 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtpraP18052 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtpraP18052 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpraP18052 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtpraP18052 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtpraP18052 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtpraP18052 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtpraP18052 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtpraP18052 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtpraP18052 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpraP18052 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtpraP18052 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtpraP18052 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtpraP18052 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtpraP18052 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtpraP18052 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtpraP18052 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtpraP18052 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtpraP18052 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PtpraP18052 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtpraP18052 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtpraP18052 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtpraP18052 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtpraP18052 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtpraP18052 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtpraP18052 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtpraP18052 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtpraP18052 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtpraP18052 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
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