Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ass1P16460 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ass1P16460 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ass1P16460 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ass1P16460 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ass1P16460 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ass1P16460 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ass1P16460 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ass1P16460 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ass1P16460 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ass1P16460 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ass1P16460 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ass1P16460 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ass1P16460 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ass1P16460 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ass1P16460 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ass1P16460 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ass1P16460 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ass1P16460 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ass1P16460 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ass1P16460 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ass1P16460 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ass1P16460 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ass1P16460 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ass1P16460 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ass1P16460 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ass1P16460 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ass1P16460 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ass1P16460 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ass1P16460 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ass1P16460 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ass1P16460 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ass1P16460 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ass1P16460 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ass1P16460 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ass1P16460 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ass1P16460 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ass1P16460 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ass1P16460 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ass1P16460 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ass1P16460 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ass1P16460 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ass1P16460 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ass1P16460 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ass1P16460 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ass1P16460 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ass1P16460 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ass1P16460 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ass1P16460 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms