Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RpsaP14206 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RpsaP14206 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RpsaP14206 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RpsaP14206 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RpsaP14206 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RpsaP14206 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RpsaP14206 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RpsaP14206 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RpsaP14206 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RpsaP14206 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RpsaP14206 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RpsaP14206 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RpsaP14206 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RpsaP14206 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RpsaP14206 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RpsaP14206 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RpsaP14206 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RpsaP14206 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RpsaP14206 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RpsaP14206 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RpsaP14206 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RpsaP14206 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RpsaP14206 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RpsaP14206 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RpsaP14206 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RpsaP14206 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RpsaP14206 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RpsaP14206 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RpsaP14206 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RpsaP14206 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RpsaP14206 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RpsaP14206 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RpsaP14206 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RpsaP14206 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RpsaP14206 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RpsaP14206 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RpsaP14206 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RpsaP14206 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RpsaP14206 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms