Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rb1P13405 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rb1P13405 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rb1P13405 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rb1P13405 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rb1P13405 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rb1P13405 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1P13405 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1P13405 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1P13405 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1P13405 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1P13405 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1P13405 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1P13405 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1P13405 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1P13405 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1P13405 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rb1P13405 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1P13405 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rb1P13405 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rb1P13405 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1P13405 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rb1P13405 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1P13405 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1P13405 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1P13405 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1P13405 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1P13405 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1P13405 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1P13405 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1P13405 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1P13405 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1P13405 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1P13405 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1P13405 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1P13405 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1P13405 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1P13405 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1P13405 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1P13405 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1P13405 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1P13405 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1P13405 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1P13405 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rb1P13405 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1P13405 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rb1P13405 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1P13405 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rb1P13405 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rb1P13405 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1P13405 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1P13405 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1P13405 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1P13405 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1P13405 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1P13405 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1P13405 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1P13405 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1P13405 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1P13405 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1P13405 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1P13405 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1P13405 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1P13405 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1P13405 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1P13405 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1P13405 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1P13405 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rb1P13405 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1P13405 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1P13405 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1P13405 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1P13405 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rb1P13405 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rb1P13405 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rb1P13405 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1P13405 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rb1P13405 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rb1P13405 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1P13405 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1P13405 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1P13405 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1P13405 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1P13405 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1P13405 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1P13405 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1P13405 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1P13405 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rb1P13405 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rb1P13405 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rb1P13405 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms