Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk1P11440 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk1P11440 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk1P11440 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk1P11440 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk1P11440 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk1P11440 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk1P11440 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk1P11440 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk1P11440 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk1P11440 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk1P11440 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk1P11440 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk1P11440 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk1P11440 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk1P11440 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk1P11440 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk1P11440 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms