Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Calm2P0DP27 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Calm2P0DP27 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Calm2P0DP27 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Calm2P0DP27 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Calm2P0DP27 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Calm2P0DP27 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Calm2P0DP27 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Calm2P0DP27 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Calm2P0DP27 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Calm2P0DP27 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Calm2P0DP27 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calm2P0DP27 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calm2P0DP27 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Calm2P0DP27 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Calm2P0DP27 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Calm2P0DP27 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Calm2P0DP27 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Calm2P0DP27 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Calm2P0DP27 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Calm2P0DP27 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Calm2P0DP27 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Calm2P0DP27 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Calm2P0DP27 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Calm2P0DP27 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Calm2P0DP27 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Calm2P0DP27 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Calm2P0DP27 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Calm2P0DP27 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Calm2P0DP27 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Calm2P0DP27 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Calm2P0DP27 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Calm2P0DP27 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Calm2P0DP27 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Calm2P0DP27 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Calm2P0DP27 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Calm2P0DP27 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Calm2P0DP27 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Calm2P0DP27 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Calm2P0DP27 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Calm2P0DP27 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Calm2P0DP27 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Calm2P0DP27 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calm2P0DP27 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calm2P0DP27 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calm2P0DP27 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calm2P0DP27 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calm2P0DP27 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Calm2P0DP27 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Calm2P0DP27 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
Calm2P0DP27 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Calm2P0DP27 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Calm2P0DP27 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Calm2P0DP27 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Calm2P0DP27 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Calm2P0DP27 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calm2P0DP27 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Calm2P0DP27 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Calm2P0DP27 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Calm2P0DP27 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Calm2P0DP27 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Calm2P0DP27 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Calm2P0DP27 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Calm2P0DP27 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Calm2P0DP27 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms