Protein–RNA interactions for Protein: P0DP26

Calm1, Calmodulin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm1P0DP26 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Calm1P0DP26 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Calm1P0DP26 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Calm1P0DP26 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Calm1P0DP26 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Calm1P0DP26 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Calm1P0DP26 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Calm1P0DP26 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Calm1P0DP26 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Calm1P0DP26 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Calm1P0DP26 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Calm1P0DP26 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Calm1P0DP26 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Calm1P0DP26 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Calm1P0DP26 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Calm1P0DP26 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Calm1P0DP26 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Calm1P0DP26 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,45■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Calm1P0DP26 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Calm1P0DP26 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Calm1P0DP26 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Calm1P0DP26 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Calm1P0DP26 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Calm1P0DP26 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Calm1P0DP26 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Calm1P0DP26 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Calm1P0DP26 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Calm1P0DP26 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Calm1P0DP26 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Calm1P0DP26 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Calm1P0DP26 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Calm1P0DP26 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Calm1P0DP26 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Calm1P0DP26 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Calm1P0DP26 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Calm1P0DP26 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Calm1P0DP26 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Calm1P0DP26 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Calm1P0DP26 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Calm1P0DP26 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Calm1P0DP26 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Calm1P0DP26 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Calm1P0DP26 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Calm1P0DP26 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Calm1P0DP26 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Calm1P0DP26 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Calm1P0DP26 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Calm1P0DP26 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Calm1P0DP26 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Calm1P0DP26 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,24
Calm1P0DP26 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Calm1P0DP26 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Calm1P0DP26 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Calm1P0DP26 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Calm1P0DP26 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Calm1P0DP26 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Calm1P0DP26 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Calm1P0DP26 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Calm1P0DP26 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Calm1P0DP26 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Calm1P0DP26 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Calm1P0DP26 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Calm1P0DP26 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Calm1P0DP26 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Calm1P0DP26 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,2 ms