Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem254aP0DN89 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tmem254aP0DN89 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem254aP0DN89 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem254aP0DN89 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem254aP0DN89 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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