Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gh1P06880 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gh1P06880 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gh1P06880 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gh1P06880 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gh1P06880 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gh1P06880 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gh1P06880 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gh1P06880 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gh1P06880 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gh1P06880 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gh1P06880 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gh1P06880 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gh1P06880 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gh1P06880 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gh1P06880 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gh1P06880 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gh1P06880 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gh1P06880 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gh1P06880 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gh1P06880 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gh1P06880 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gh1P06880 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gh1P06880 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gh1P06880 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gh1P06880 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gh1P06880 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gh1P06880 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gh1P06880 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gh1P06880 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gh1P06880 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gh1P06880 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gh1P06880 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gh1P06880 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gh1P06880 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gh1P06880 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gh1P06880 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gh1P06880 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms