Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Me1P06801 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Me1P06801 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Me1P06801 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Me1P06801 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Me1P06801 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Me1P06801 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Me1P06801 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Me1P06801 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Me1P06801 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Me1P06801 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Me1P06801 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Me1P06801 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Me1P06801 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Me1P06801 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Me1P06801 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Me1P06801 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Me1P06801 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Me1P06801 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Me1P06801 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Me1P06801 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Me1P06801 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Me1P06801 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Me1P06801 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Me1P06801 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Me1P06801 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Me1P06801 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Me1P06801 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Me1P06801 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Me1P06801 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Me1P06801 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Me1P06801 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Me1P06801 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Me1P06801 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Me1P06801 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Me1P06801 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Me1P06801 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Me1P06801 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Me1P06801 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Me1P06801 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Me1P06801 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Me1P06801 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Me1P06801 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Me1P06801 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Me1P06801 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Me1P06801 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Me1P06801 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Me1P06801 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Me1P06801 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Me1P06801 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Me1P06801 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Me1P06801 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Me1P06801 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Me1P06801 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Me1P06801 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Me1P06801 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Me1P06801 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Me1P06801 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Me1P06801 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Me1P06801 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Me1P06801 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Me1P06801 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Me1P06801 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Me1P06801 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Me1P06801 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Me1P06801 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Me1P06801 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Me1P06801 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Me1P06801 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Me1P06801 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Me1P06801 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Me1P06801 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Me1P06801 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Me1P06801 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Me1P06801 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Me1P06801 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Me1P06801 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Me1P06801 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Me1P06801 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Me1P06801 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Me1P06801 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Me1P06801 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Me1P06801 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Me1P06801 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Me1P06801 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Me1P06801 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Me1P06801 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Me1P06801 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Me1P06801 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Me1P06801 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Me1P06801 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Me1P06801 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Me1P06801 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Me1P06801 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Me1P06801 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Me1P06801 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Me1P06801 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Me1P06801 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Me1P06801 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Me1P06801 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms