Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P06336 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P06336 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P06336 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P06336 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P06336 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P06336 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P06336 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P06336 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P06336 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P06336 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P06336 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P06336 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P06336 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P06336 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P06336 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P06336 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P06336 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
P06336 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P06336 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P06336 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
P06336 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P06336 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P06336 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P06336 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P06336 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P06336 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P06336 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P06336 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P06336 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P06336 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P06336 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P06336 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P06336 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P06336 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P06336 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P06336 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P06336 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P06336 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P06336 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P06336 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P06336 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P06336 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P06336 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P06336 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P06336 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P06336 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P06336 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P06336 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P06336 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
P06336 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P06336 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P06336 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P06336 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P06336 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P06336 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P06336 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P06336 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P06336 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P06336 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P06336 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P06336 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P06336 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P06336 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P06336 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P06336 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P06336 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P06336 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P06336 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P06336 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P06336 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P06336 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P06336 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P06336 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P06336 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P06336 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P06336 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P06336 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P06336 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P06336 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P06336 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P06336 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P06336 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P06336 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P06336 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P06336 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P06336 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P06336 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P06336 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P06336 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P06336 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P06336 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P06336 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P06336 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23■■□□□ 1.27
P06336 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P06336 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P06336 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06336 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06336 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06336 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms