Protein–RNA interactions for Protein: P06240

Lck, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase LCK, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LckP06240 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LckP06240 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LckP06240 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LckP06240 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LckP06240 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LckP06240 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LckP06240 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LckP06240 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LckP06240 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LckP06240 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LckP06240 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LckP06240 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LckP06240 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LckP06240 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LckP06240 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LckP06240 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LckP06240 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LckP06240 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LckP06240 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LckP06240 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LckP06240 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LckP06240 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LckP06240 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LckP06240 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LckP06240 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LckP06240 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LckP06240 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LckP06240 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LckP06240 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LckP06240 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LckP06240 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LckP06240 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LckP06240 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LckP06240 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LckP06240 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LckP06240 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LckP06240 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LckP06240 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LckP06240 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LckP06240 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LckP06240 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LckP06240 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LckP06240 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LckP06240 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LckP06240 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LckP06240 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LckP06240 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LckP06240 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LckP06240 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LckP06240 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LckP06240 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LckP06240 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LckP06240 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LckP06240 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LckP06240 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LckP06240 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LckP06240 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LckP06240 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LckP06240 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LckP06240 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LckP06240 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LckP06240 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LckP06240 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LckP06240 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LckP06240 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LckP06240 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LckP06240 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LckP06240 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LckP06240 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LckP06240 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LckP06240 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LckP06240 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LckP06240 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LckP06240 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LckP06240 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LckP06240 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LckP06240 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LckP06240 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LckP06240 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LckP06240 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LckP06240 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LckP06240 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LckP06240 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LckP06240 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LckP06240 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LckP06240 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LckP06240 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LckP06240 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LckP06240 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LckP06240 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LckP06240 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LckP06240 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LckP06240 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LckP06240 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LckP06240 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LckP06240 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LckP06240 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LckP06240 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LckP06240 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LckP06240 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms