Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt1P04104 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt1P04104 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt1P04104 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt1P04104 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt1P04104 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt1P04104 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt1P04104 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt1P04104 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt1P04104 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt1P04104 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt1P04104 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt1P04104 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt1P04104 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt1P04104 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt1P04104 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt1P04104 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms