Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtnd1P03888 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtnd1P03888 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtnd1P03888 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtnd1P03888 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtnd1P03888 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtnd1P03888 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtnd1P03888 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mtnd1P03888 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtnd1P03888 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtnd1P03888 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtnd1P03888 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mtnd1P03888 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mtnd1P03888 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mtnd1P03888 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtnd1P03888 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtnd1P03888 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mtnd1P03888 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mtnd1P03888 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mtnd1P03888 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtnd1P03888 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtnd1P03888 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtnd1P03888 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mtnd1P03888 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mtnd1P03888 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms