Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spsb2O88838 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spsb2O88838 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spsb2O88838 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spsb2O88838 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spsb2O88838 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spsb2O88838 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spsb2O88838 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spsb2O88838 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spsb2O88838 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spsb2O88838 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spsb2O88838 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spsb2O88838 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spsb2O88838 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spsb2O88838 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spsb2O88838 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spsb2O88838 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spsb2O88838 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spsb2O88838 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spsb2O88838 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spsb2O88838 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spsb2O88838 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spsb2O88838 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spsb2O88838 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spsb2O88838 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spsb2O88838 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spsb2O88838 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spsb2O88838 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms