Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Orc4O88708 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Orc4O88708 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Orc4O88708 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Orc4O88708 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Orc4O88708 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Orc4O88708 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Orc4O88708 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Orc4O88708 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Orc4O88708 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Orc4O88708 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Orc4O88708 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Orc4O88708 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Orc4O88708 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Orc4O88708 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Orc4O88708 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Orc4O88708 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Orc4O88708 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Orc4O88708 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Orc4O88708 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Orc4O88708 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Orc4O88708 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Orc4O88708 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Orc4O88708 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Orc4O88708 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Orc4O88708 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Orc4O88708 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Orc4O88708 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Orc4O88708 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Orc4O88708 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Orc4O88708 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Orc4O88708 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Orc4O88708 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Orc4O88708 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Orc4O88708 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Orc4O88708 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Orc4O88708 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Orc4O88708 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Orc4O88708 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Orc4O88708 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Orc4O88708 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Orc4O88708 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Orc4O88708 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Orc4O88708 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Orc4O88708 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Orc4O88708 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Orc4O88708 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Orc4O88708 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Orc4O88708 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Orc4O88708 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Orc4O88708 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Orc4O88708 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Orc4O88708 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Orc4O88708 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Orc4O88708 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Orc4O88708 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Orc4O88708 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Orc4O88708 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Orc4O88708 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Orc4O88708 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Orc4O88708 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Orc4O88708 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Orc4O88708 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Orc4O88708 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Orc4O88708 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Orc4O88708 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Orc4O88708 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Orc4O88708 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Orc4O88708 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Orc4O88708 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Orc4O88708 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Orc4O88708 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Orc4O88708 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Orc4O88708 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Orc4O88708 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Orc4O88708 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Orc4O88708 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Orc4O88708 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Orc4O88708 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.1 ms