Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
BlmO88700 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
BlmO88700 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
BlmO88700 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
BlmO88700 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
BlmO88700 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
BlmO88700 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
BlmO88700 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
BlmO88700 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
BlmO88700 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
BlmO88700 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
BlmO88700 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
BlmO88700 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
BlmO88700 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
BlmO88700 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
BlmO88700 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
BlmO88700 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
BlmO88700 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
BlmO88700 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
BlmO88700 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
BlmO88700 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
BlmO88700 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
BlmO88700 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
BlmO88700 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
BlmO88700 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
BlmO88700 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
BlmO88700 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
BlmO88700 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
BlmO88700 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
BlmO88700 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
BlmO88700 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
BlmO88700 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
BlmO88700 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40.03■■■■■ 4
BlmO88700 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
BlmO88700 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
BlmO88700 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
BlmO88700 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
BlmO88700 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
BlmO88700 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
BlmO88700 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
BlmO88700 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
BlmO88700 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
BlmO88700 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
BlmO88700 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
BlmO88700 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
BlmO88700 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
BlmO88700 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
BlmO88700 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
BlmO88700 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
BlmO88700 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
BlmO88700 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
BlmO88700 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
BlmO88700 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
BlmO88700 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
BlmO88700 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
BlmO88700 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
BlmO88700 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
BlmO88700 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
BlmO88700 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
BlmO88700 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
BlmO88700 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
BlmO88700 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
BlmO88700 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
BlmO88700 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
BlmO88700 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
BlmO88700 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
BlmO88700 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
BlmO88700 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
BlmO88700 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
BlmO88700 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
BlmO88700 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
BlmO88700 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
BlmO88700 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
BlmO88700 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
BlmO88700 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
BlmO88700 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
BlmO88700 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
BlmO88700 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
BlmO88700 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
BlmO88700 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
BlmO88700 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
BlmO88700 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
BlmO88700 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
BlmO88700 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
BlmO88700 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
BlmO88700 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
BlmO88700 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
BlmO88700 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
BlmO88700 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
BlmO88700 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
BlmO88700 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
BlmO88700 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
BlmO88700 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
BlmO88700 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
BlmO88700 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
BlmO88700 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
BlmO88700 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
BlmO88700 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
BlmO88700 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
BlmO88700 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms