Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Kdm6aO70546 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Kdm6aO70546 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Kdm6aO70546 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Kdm6aO70546 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Kdm6aO70546 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Kdm6aO70546 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Kdm6aO70546 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Kdm6aO70546 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Kdm6aO70546 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Kdm6aO70546 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Kdm6aO70546 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33,86■■■■□ 3,01
Kdm6aO70546 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Kdm6aO70546 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Kdm6aO70546 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Kdm6aO70546 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Kdm6aO70546 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Kdm6aO70546 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Kdm6aO70546 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Kdm6aO70546 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,77■■■■□ 3
Kdm6aO70546 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Kdm6aO70546 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Kdm6aO70546 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Kdm6aO70546 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Kdm6aO70546 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Kdm6aO70546 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,98
Kdm6aO70546 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Kdm6aO70546 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Kdm6aO70546 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Kdm6aO70546 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Kdm6aO70546 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Kdm6aO70546 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Kdm6aO70546 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Kdm6aO70546 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Kdm6aO70546 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33,62■■■□□ 2,97
Kdm6aO70546 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Kdm6aO70546 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Kdm6aO70546 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Kdm6aO70546 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Kdm6aO70546 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Kdm6aO70546 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Kdm6aO70546 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Kdm6aO70546 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Kdm6aO70546 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Kdm6aO70546 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Kdm6aO70546 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Kdm6aO70546 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Kdm6aO70546 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Kdm6aO70546 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Kdm6aO70546 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Kdm6aO70546 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Kdm6aO70546 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Kdm6aO70546 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Kdm6aO70546 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Kdm6aO70546 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Kdm6aO70546 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Kdm6aO70546 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Kdm6aO70546 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Kdm6aO70546 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Kdm6aO70546 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Kdm6aO70546 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Kdm6aO70546 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Kdm6aO70546 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33,39■■■□□ 2,94
Kdm6aO70546 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33,39■■■□□ 2,94
Kdm6aO70546 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33,38■■■□□ 2,93
Kdm6aO70546 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Kdm6aO70546 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33,36■■■□□ 2,93
Kdm6aO70546 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Kdm6aO70546 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Kdm6aO70546 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Kdm6aO70546 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Kdm6aO70546 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33,32■■■□□ 2,93
Kdm6aO70546 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33,26■■■□□ 2,92
Kdm6aO70546 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Kdm6aO70546 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Kdm6aO70546 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Kdm6aO70546 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Kdm6aO70546 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
Kdm6aO70546 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Kdm6aO70546 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Kdm6aO70546 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
Kdm6aO70546 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Kdm6aO70546 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Kdm6aO70546 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
Kdm6aO70546 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Kdm6aO70546 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Kdm6aO70546 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Kdm6aO70546 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51,9 ms