Protein–RNA interactions for Protein: O55189

Ambn, Ameloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbnO55189 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AmbnO55189 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmbnO55189 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmbnO55189 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AmbnO55189 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AmbnO55189 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AmbnO55189 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmbnO55189 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmbnO55189 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmbnO55189 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmbnO55189 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmbnO55189 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmbnO55189 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AmbnO55189 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmbnO55189 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmbnO55189 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmbnO55189 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AmbnO55189 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AmbnO55189 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AmbnO55189 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AmbnO55189 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AmbnO55189 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AmbnO55189 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AmbnO55189 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AmbnO55189 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AmbnO55189 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AmbnO55189 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AmbnO55189 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AmbnO55189 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AmbnO55189 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmbnO55189 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms