Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap1O55125 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nipsnap1O55125 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nipsnap1O55125 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap1O55125 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap1O55125 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nipsnap1O55125 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nipsnap1O55125 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap1O55125 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nipsnap1O55125 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap1O55125 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap1O55125 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap1O55125 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nipsnap1O55125 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap1O55125 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap1O55125 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms