Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syngr1O55100 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syngr1O55100 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syngr1O55100 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syngr1O55100 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syngr1O55100 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syngr1O55100 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syngr1O55100 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Syngr1O55100 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syngr1O55100 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syngr1O55100 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms