Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cd200O54901 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cd200O54901 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cd200O54901 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Cd200O54901 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cd200O54901 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cd200O54901 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cd200O54901 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cd200O54901 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,97■□□□□ 0,95
Cd200O54901 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cd200O54901 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cd200O54901 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20,96■□□□□ 0,95
Cd200O54901 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cd200O54901 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cd200O54901 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Cd200O54901 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Cd200O54901 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Cd200O54901 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Cd200O54901 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cd200O54901 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cd200O54901 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20,82■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cd200O54901 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Cd200O54901 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cd200O54901 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,91
Cd200O54901 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cd200O54901 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20,64■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cd200O54901 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20,6■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Cd200O54901 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cd200O54901 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cd200O54901 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cd200O54901 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cd200O54901 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Cd200O54901 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Cd200O54901 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,9 ms