Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lgals6O54891 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lgals6O54891 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgals6O54891 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgals6O54891 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lgals6O54891 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms