Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChkaO54804 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChkaO54804 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ChkaO54804 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ChkaO54804 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChkaO54804 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChkaO54804 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ChkaO54804 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ChkaO54804 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ChkaO54804 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChkaO54804 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChkaO54804 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChkaO54804 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChkaO54804 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChkaO54804 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ChkaO54804 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChkaO54804 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChkaO54804 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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