Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccr6O54689 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr6O54689 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr6O54689 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr6O54689 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr6O54689 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr6O54689 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr6O54689 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr6O54689 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr6O54689 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr6O54689 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr6O54689 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr6O54689 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccr6O54689 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccr6O54689 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccr6O54689 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr6O54689 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccr6O54689 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccr6O54689 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccr6O54689 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccr6O54689 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr6O54689 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr6O54689 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr6O54689 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccr6O54689 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr6O54689 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms