Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pik3cdO35904 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pik3cdO35904 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pik3cdO35904 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pik3cdO35904 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pik3cdO35904 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pik3cdO35904 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pik3cdO35904 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pik3cdO35904 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pik3cdO35904 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pik3cdO35904 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pik3cdO35904 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pik3cdO35904 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pik3cdO35904 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pik3cdO35904 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pik3cdO35904 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pik3cdO35904 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pik3cdO35904 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3cdO35904 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3cdO35904 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3cdO35904 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3cdO35904 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3cdO35904 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3cdO35904 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3cdO35904 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pik3cdO35904 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pik3cdO35904 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pik3cdO35904 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms