Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppef2O35385 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppef2O35385 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppef2O35385 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppef2O35385 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ppef2O35385 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ppef2O35385 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppef2O35385 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppef2O35385 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppef2O35385 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppef2O35385 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppef2O35385 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppef2O35385 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppef2O35385 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppef2O35385 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppef2O35385 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppef2O35385 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppef2O35385 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ppef2O35385 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ppef2O35385 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ppef2O35385 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppef2O35385 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppef2O35385 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppef2O35385 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppef2O35385 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppef2O35385 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppef2O35385 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppef2O35385 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppef2O35385 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppef2O35385 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppef2O35385 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppef2O35385 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ppef2O35385 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppef2O35385 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppef2O35385 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppef2O35385 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppef2O35385 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppef2O35385 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppef2O35385 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppef2O35385 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppef2O35385 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppef2O35385 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppef2O35385 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms