Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cx3cl1O35188 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cx3cl1O35188 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cx3cl1O35188 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cx3cl1O35188 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cx3cl1O35188 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cx3cl1O35188 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cx3cl1O35188 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cx3cl1O35188 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cx3cl1O35188 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cx3cl1O35188 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cx3cl1O35188 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cx3cl1O35188 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cx3cl1O35188 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cx3cl1O35188 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cx3cl1O35188 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cx3cl1O35188 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cx3cl1O35188 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cx3cl1O35188 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cx3cl1O35188 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cx3cl1O35188 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cx3cl1O35188 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cx3cl1O35188 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cx3cl1O35188 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cx3cl1O35188 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cx3cl1O35188 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cx3cl1O35188 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cx3cl1O35188 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cx3cl1O35188 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cx3cl1O35188 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cx3cl1O35188 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cx3cl1O35188 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cx3cl1O35188 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cx3cl1O35188 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cx3cl1O35188 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cx3cl1O35188 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cx3cl1O35188 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cx3cl1O35188 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cx3cl1O35188 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cx3cl1O35188 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms