Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casq2O09161 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casq2O09161 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casq2O09161 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casq2O09161 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq2O09161 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casq2O09161 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casq2O09161 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casq2O09161 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casq2O09161 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casq2O09161 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casq2O09161 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casq2O09161 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casq2O09161 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casq2O09161 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq2O09161 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casq2O09161 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casq2O09161 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq2O09161 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq2O09161 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Casq2O09161 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq2O09161 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq2O09161 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casq2O09161 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casq2O09161 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casq2O09161 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casq2O09161 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casq2O09161 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casq2O09161 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casq2O09161 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casq2O09161 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms