Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema4dO09126 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sema4dO09126 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema4dO09126 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Sema4dO09126 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sema4dO09126 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Sema4dO09126 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sema4dO09126 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema4dO09126 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema4dO09126 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sema4dO09126 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sema4dO09126 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sema4dO09126 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sema4dO09126 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Sema4dO09126 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema4dO09126 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sema4dO09126 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema4dO09126 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema4dO09126 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema4dO09126 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema4dO09126 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sema4dO09126 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sema4dO09126 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sema4dO09126 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema4dO09126 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema4dO09126 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sema4dO09126 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sema4dO09126 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sema4dO09126 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema4dO09126 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema4dO09126 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sema4dO09126 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sema4dO09126 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sema4dO09126 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema4dO09126 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema4dO09126 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema4dO09126 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema4dO09126 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema4dO09126 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sema4dO09126 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sema4dO09126 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema4dO09126 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema4dO09126 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema4dO09126 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema4dO09126 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema4dO09126 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema4dO09126 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema4dO09126 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema4dO09126 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema4dO09126 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema4dO09126 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema4dO09126 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema4dO09126 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema4dO09126 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema4dO09126 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema4dO09126 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4dO09126 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4dO09126 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sema4dO09126 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema4dO09126 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema4dO09126 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema4dO09126 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema4dO09126 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema4dO09126 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms